柳枝稷TIFY基因家族的鑒定與分析

趙曉曉; 謝坤良; 張舒夢; 張超; 奚亞軍; 孫風麗 西北農林科技大學農學院; 陜西楊凌712100

關鍵詞:柳枝稷 tify基因家族 jaz 

摘要:為探究TIFY基因家族在柳枝稷(Panicum virgatum)中的生物學功能,本研究運用生物信息學手段對柳枝稷基因組中的TIFY家族成員進行了鑒定,并對其染色體定位、進化與結構特點、啟動子區順式作用元件、時空表達模式等進行了分析,且通過定量實驗驗證了JAZ亞家族部分成員的激素應答與脅迫響應特性。結果表明:48個柳枝稷TIFY基因分屬于ZML(7個)、TIFY(1個)與JAZ(40個)3個亞家族,分布在除染色體3以外的染色體上,且在染色體9成簇排列;柳枝稷TIFY基因按照進化關系及結構特點可分為5組,每組內的成員具有相似的基因結構與保守基序組成;柳枝稷TIFY基因啟動子區存在多種脅迫響應元件與激素信號調控元件,經定量實驗證實PviTIFY10各成員在茉莉酸(jasmonic acid,JA)處理及鹽與干旱脅迫下反應強烈;JAZ亞家族部分成員尤其是PviTIFY10b在花序與根的發育過程中有較高表達。根據以上結果推測TIFY基因家族可能在柳枝稷激素信號調控與脅迫防御反應及生長發育等多方面發揮功能。

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