金烏賊微衛星標記開發及兩個野生群體遺傳多樣性比較

王鶴; 李戰軍; 王亮; 王增東; 賀加貝; 劉永勝 煙臺市海洋經濟研究院; 山東煙臺264003; 山東省水生動物資源養護管理中心; 山東煙臺264003; 山東安源水產股份有限公司; 山東煙臺265617

關鍵詞:金烏賊 微衛星標記 野生群體 遺傳多樣性 

摘要:為進一步了解金烏賊Sepia esculenta野生群體遺傳多樣性水平,采用磁珠富集法從金烏賊基因組中開發了微衛星標記,并應用青島(QD)金烏賊野生群體對其多態性進行評價,進而比較了青島和長江口(CJK)兩個野生群體的遺傳差異。結果表明:開發標記的種群遺傳學評價顯示,在269個克隆子中,有192個含有微衛星序列(71.38%),基于該序列設計85對引物,其中20對通過篩選,完美型占60%,非完美型占10%,復合型占30%;經群體驗證,表觀等位基因數(A)為2~17不等,平均為8.15,觀測雜合度(HO)分布范圍為0.146~0.936,平均為0.630,期望雜合度(HE)分布范圍為0.172~0.930,平均為0.702;其中5個位點不符合哈迪-溫伯格(Hardy-Weinberg)平衡預期,存在零等位基因可能是其偏離平衡的原因;應用本研究開發的引物對2個近源種擴增,開發的20個標記位點中有6個在針烏賊Sepia andreana中表現為多態,4個位點在曼氏無針烏賊Sepiella maindroni中表現為多態;應用開發的11個位點對青島和長江口兩個野生群體進行遺傳差異分析顯示,所有位點中,青島群體共檢測到163個等位基因,長江口群體共檢測到152個等位基因,每個位點的等位基因數為5~28和6~26不等,平均等位基因數分別為14.818和13.818;青島群體獨有等位基因19個,觀測雜合度分布范圍為0.250~0.936,平均為0.731,期望雜合度分布范圍為0.265~0.930,平均為0.771,多態信息含量為0.223~0.946,平均為0.746;長江口群體獨有等位基因8個,觀測雜合度分布范圍為0.500~0.896,平均為0.731,期望雜合度分布范圍為0.623~0.960,平均為0.857,多態信息含量為0.614~0.948,平均為0.845;群體間遺傳分化較弱(Fst值為0.032 5),群體分配分析結果表明,兩個種群中所有個體正確分配到各自種群的概率分別為86.4%和84.0%。研究表明,本試驗中開發的微衛星標記位點多樣性水平略低于前人的研究,但有一定的跨種擴增通用性,長江口群體多樣性?

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