NCOA2促進急性B淋巴細胞白血病細胞增殖及下游信號通路的生物信息學分析

張國君; 張歡; 陳念慈; 張彩霞; 魏雪婷; 劉卓剛 中國醫科大學附屬盛京醫院第一血液內科; 沈陽遼寧110022

關鍵詞:急性b淋巴細胞白血病 ncoa2 細胞增殖 生物信息學 

摘要:目的探討核受體輔激活因子2(Nuclear Receptor Coactivator2,NCOA2)在急性B淋巴細胞白血病(B-ALL)細胞增殖中的作用,并利用生物信息學方法探究NCOA2促進B-ALL細胞增殖涉及的基因和信號通路。方法在B-ALL細胞Nalm6及BALL-1中使用siRNA技術敲減NCOA2,通過Western blot檢測NCOA2的敲除效率,通過EdU方法檢測Nalm6及BALL-1細胞的增殖能力變化;使用GEO2R軟件分析NCOA2敲減細胞系的表達譜數據(GSE118992),找到有意義的差異基因;使用DAVID和KOBAS軟件對差異基因進行GO和KEGG分析,對差異基因的作用和參與的信號通路進行聚類分析;使用Venny2.1軟件對GO和KEGG中參與調控細胞增殖的因子進行并集分析;使用STRING軟件分析參與NCOA2調節細胞增殖相關基因之間的相互作用關系。結果NCOA2siRNA能夠抑制NCOA2蛋白表達和Nalm6及BALL-1細胞的增殖能力,同時篩選出受其調控的差異顯著性基因322個,選擇排在前十位的生物學功能和信號通路,把其中參與調節細胞增殖的基因取并集,找到受NCOA2調控的參與細胞增殖的4個基因(TGFBR2、CRKL、CCND2、PDGFRA),發現它們之間具有相關作用關系。結論NCOA2調節細胞增殖相關因子(TGFBR2、CRKL、CCND2、PDGFRA),參與B淋巴細胞白血病發生發展。

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