關鍵詞：塞尼卡谷病毒 vp1蛋白 遺傳進化分析 

摘要：塞尼卡谷病毒(Seneca Valley virus,SVV)是一種新發的豬病毒病,在我國豬群中已形成一定的流行性。本文首先對豫北一豬場發生水泡癥狀的豬進行病料采集,然后提取病毒RNA,通過反轉錄和PCR擴增到SVV的VP1基因,并對其進行測序。通過MegAlign軟件對VP1基因序列進行遺傳進化分析,利用在線生物信息學軟件預測VP1蛋白的信號肽、核定位信號和B細胞表位。結果表明:豫北毒株與一株美國毒株USA-IA44952(登錄號為KU954090.1)的核苷酸同源性最高,與SVV-001毒株核苷酸同源性最低(登錄號為DQ641257.1),VP1蛋白沒有信號肽序列,沒有核定位信號,有8個B細胞線性抗原表位。

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