干旱脅迫下青稞全基因組可變剪切分析

曾興權; 原紅軍; 楊春葆; 于明寨; 徐齊君; 王玉林; 扎桑; 尼瑪扎西 省部共建青稞和牦牛種質資源與遺傳改良國家重點實驗室; 西藏拉薩850002; 西藏自治區農牧科學院農業研究所; 西藏拉薩850002; 西藏自治區農牧科學院; 西藏拉薩850002

關鍵詞:青稞 干旱脅迫 全基因組 可變剪切分析 

摘要:為闡明青稞在旱脅迫下基因發生可變剪切的規律,本研究以抗旱的“喜拉16號”和旱敏感的“迪慶黑元桂”為試驗材料,分別對對照和21%PEG濃度下處理的樣本進行多時間點的全轉錄組測序。結果表明,利用LeafCutter軟件在所有的樣品中共檢測到了22181個可變剪切事件;通過PCA分析發現,可變剪切具有明顯的品種間特異性;另外,通過與抗旱基因數據庫比對分析發現,在干旱脅迫處理下2個類型品種間有多個抗旱相關的基因發生了顯著的差異可變剪切,分別是HVUL1H16429(AtrbohF)、HVUL1H12808(HAB1)、HVUL4H58649(ABF4)、HVUL4H35985(AtrbohD)、HVUL7H07799(LOS5)、HVUL3H43774(CLCc)、HVUL3H23631(ABCG40)、HVUL1H16840(MYB60)和HVUL6H08236(AREB1);對2個品種各自在對照與旱脅迫條件下的差異可變剪切基因進行pathway分析,發現了抗旱品種的差異可變剪切基因參與了更多的pathway,并且鑒別出Fatty acid degradation、Inositol phosphate metabolism、alpha-Linolenic acid metabolism和Fatty acid metabolism這4條通路顯著富集。為解析青稞抗旱分子機理與培育青稞抗旱新品種奠定了理論基礎。

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