雞FGF13基因生物信息學及組織表達分析

邢偉杰; 趙東偉; 李尚民; 范建華; 蔣一秀; 金波 江蘇省家禽科學研究所; 江蘇揚州225125; 揚州翔龍禽業發展有限公司; 江蘇揚州225125

關鍵詞:雞 成纖維細胞生長因子13 序列分析 結構預測 表達模式 

摘要:研究使用多種生物信息學分析軟件和多種在線生物信息分析工具,探究雞成纖維細胞生長因子13(FGF13)基因及其編碼蛋白的序列結構及遺傳學特性,并分析其組織表達情況。結果顯示:雞FGF13基因編碼區DNA序列長582 bp,共編碼氨基酸193個;同源性分析發現,雞FGF13基因具有較高的保守性,其核苷酸序列及其編碼的氨基酸序列與鳥類中鴿和火雞的同源性均達95%以上;氨基酸序列分析發現,該蛋白為不穩定的水溶性蛋白,分子質量為21.65 ku,理論等電點為9.33,無信號肽序列;亞細胞定位主要為細胞核內,屬于非分泌蛋白;預測含有30個磷酸化位點,3個糖基化位點,具有FGF結構域;二級結構主要以無規則卷曲和β折疊為主,三級結構為卷曲狀折疊結構;該基因在雞早期生長過程中隨周齡的增大在腿肌中的表達量呈下降模式。研究結果為FGF13基因功能的進一步分析,以及該基因在雞生長發育及其他方面調控作用研究提供了更充分的分子生物學基礎信息和理論依據。

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